Un estudio efectuado por el programa Cuenca Poopó establece que hay 3,9 toneladas de zinc, 0,8 toneladas de arsénico, 40 kilos de cadmio, 73 kilos de plomo, que se vacían por día en el lago, motivo por el cual urge la necesidad de que la Gobernación destine gran parte de sus recursos para la mitigación del medioambiente.
El director del programa de Gestión Sostenible de los Recursos Naturales de la Cuenca del Lago Poopó, Eduardo Ortiz, dijo que el lago “recibe todas las contaminaciones a través de sus afluentes, que provienen de varios distritos mineros. Existe acidificación de suelos, que deterioran su calidad, debido a la acumulación de residuos sólidos”.
A la contaminación con minerales, también se acumulan las aguas servidas del improvisado sistema de alcantarillado sanitario que tiene la población de Huanuni, que desemboca directamente hacia el río.